Les extrêmozymes

Définition:
Enzymes issues de micro-organismes vivants dans des environnements extrêmes:( Archaébactéries, eubactéries)
ou
enzymes modifiées par génie génétique et pouvant agir dans des conditions extra-physiologiques.

Classification:

Quelques caractéristiques

Les enzymes halophiles:

  1. enzymes produites par des micro-organismes halophiles(optimum de croissance bactérienne: 2,5 mol/L NaCl; KCl cytoplasmique proche de la saturation)
    - Archaea aérobies halophiles (halobacteriaceae)
    - Archaea méthanogènes halophiles
    - Bactéries halophiles
  2. enzymes dont l’activité, la stabilité ou la solubilité dépendent de la présence de sels

Caractéristiques des enzymes halophiles:

  • composition en acides aminés: riches en acides aminés acides
  • stables et solubles pour des concentrations élevées en sels
  • instables pour de faibles concentrations en sels (<1 mol/L)
  • Effets des sels sur l’activité et la stabilité des enzymes: variable selon les enzymes
    - béta-galactosidase de Haloferax alicantei: activité augmente jusqu’à 4 mol/L NaCl
    - glutamate-déshydrogénase de Haloarcula marismortui: activité augmente jusqu’à 1 mol/L NaCl puis reste stable.
    Enzyme active sous forme tétramèrique, stable en présence de NaCl 4 mol/L, se dissocie en monomères en dessous de NaCl 2 mol/L et est rapidement inactivée, stable et active en présence de 0,35 mol/L NaCl et de 10 µmol/L NADH.
    (structure 3 D: biochem.ucl.ac.uk )

Les enzymes psychrophiles:

Enzymes produites par des micro-organismes psychrophiles (bactéries, levures, champignons, algues unicellulaires) capables de croissance à des températures voisines de 0°C.
Limite supérieure de croissance des bactéries: 20°C
Provenance: arctique et antarctique.
Très peu de recherches ont été engagées sur ce sujet, pourtant la majeure partie de la planète est froide (<5°C)

Peu d’enzymes psychrophiles ont été étudiées: alpha-amylase, aspartate transcarbamylase, Ca2+- Zn2+ protéase, MDH, subtilisine,xylanase…)

Caractéristiques des enzymes psychrophiles:

Les activités spécifiques des enzymes psycrophiles sont nettement supérieures à celles de leurs homologues mésophiles pour des températures de 0-30°C.
A des températures > 30°C, ces enzymes sont rapidement dénaturées.
Les propriétés catalytiques de ces enzymes seraient associées à une grande flexibilité des structures protéiques à basse température. La stratégie structurale d’adaptation au froid est différente pour chaque enzyme

Les enzymes thermophiles:

Enzymes produites par des micro-organismes thermophiles et hyperthermophiles (bactéries, champignons) capables de croissance à des températures entre 60-108°C.
Biotopes de ces micro-organismes : sources hydrothermales et volcaniques terrestres ou sous marines.
Thermophiles extrêmes (T°C 60-80) : eubactéries (Bacillus, Thermus, Clostridium….) Hyperthermophiles (T°C 80-110): archébactéries (Sulfolobus, Thermoproteus, Thermococcus, Pyrococcus…)

 

Extrêmophile
Habitat
Exemples d'activités enzymatiques
Quelques applications
Halophile Forte concentration en sel Malate déshydrogénase Dispositif de régénération des résine échangeuse d'ions
Psychrophile Basse température Protéases
Déshydrogénases
Amylases
Cellulases
Lipases, Protéases,Amylases
Fabricaion des fromages
Biocapteurs
Dégradation des polymères
Délavage des textiles
Lessives basse température
Thermophile

Haute température

  • Thermophiles modérés (45-65°C)
  • Thermophiles (65-85°C)
  • Hyperthermophiles (>85°C)

Amylases
Xylanases
Protéases
DNA-polymérases

Production de glucose et de fructose
Blanchissement du papier
Industrie des lessives
Génie génétique
Acidophile Faible pH Oxydation des sulfures Désulfurisation du charbon
Alcalophile Fort pH Cellulases Dégradation des polymères (lessives)
Piezophile Haute pression Micro-organisme entier Formation de gels et de granules d'amidon
Metalophile Forte concentration en métal Micro-organisme entier Biominéralisation
Radiophile Fort taux de radiation Micro-organisme entier Travail sur sites contaminés

Utilisation des enzymes dans les procédés industriels: Avantages et inconvénients